器灵系统是少年三国志2中提升武将战力的重要组成部分，通过为武将装备器灵可获得额外属性加成和特殊技能效果。器灵品质分为绿色、蓝色、紫色和橙色四种，级别从1至12级不等，品质和等级越高带来的增益效果越显著。器灵主要通过器灵副本挑战、商店购买、装备分解三种常规途径获取，其中器灵副本是最稳定的获取方式，每次挑战都有概率掉落随机器灵。
器灵技能主要分为属性强化型和战场功能型两大类。属性强化型包括直接提升攻击力、防御力、生命值等基础属性，其中攻击资质会按百分比增幅武器固定攻击力，计算公式为装备总固定攻击力=基础固定攻击力(1+攻击资质)。元素攻击则直接参与武将面板计算，这类技能适合针对性强化武将的核心属性。战场功能型技能则包含暴击率提升、命中率增强、伤害减免等战斗特效，能显著改变实战表现。
器灵融合是提升技能效果的关键机制，需要将两个同名器灵进行融合生成新器灵。融合时必须选择相近评分且技能数量相同的器灵，否则会导致属性下降或技能数量减少。成功融合后不仅会提升器灵属性，还可能增加技能槽位，最高可拥有4个技能。技能书用于让器灵领悟新技能，建议在器灵融合至满技能槽后再使用技能书，避免资源浪费。
在实战应用中，器灵技能能产生攻防转换、战场控制等战略价值。部分高阶器灵具备改变战场局势的特殊效果，如降低敌人攻击速度、施加持续伤害、恢复己方血量甚至复活阵亡武将。这些技能需要根据敌方阵容特点进行针对性配置，例如面对高爆发阵容时可选择防御加固类器灵，对抗持久战时则优先考虑恢复类技能。合理的器灵搭配能使武将能力产生质变。
